Древнее село Заболотье расположилось на реке Соти. Само название говорит о его расположении за болотом. В XVI - начале ХVII вв. Заболотье - дворцовое село с деревянной церковью Михаила Архангела. В марте 1544 г. царь Иоанн Грозный ездил в Калязинский монастырь и, направляясь оттуда в Троице-Сергиев, заезжал в Заболотье, где для него была приготовлена медвежья охота. В 1708 г. село было во владении стольника Федора Петровича Дубровского. И при нем стояла деревянная церковь архангела Михаила.

С 1734 г. Заболотье стало владением графа Семена Андреевича Салтыкова. На следующий год он построил деревянную церковь Покрова Пресвятой Богородицы с приделами в честь пророка Божия Илии и архангела Михаила. При императрице Анне Иоанновне, которой он был родственник, С.А.Салтыков стал одним из могущественнейших сановников империи. С 1732 г. он был назначен московским главнокомандующим. Историк свидетельствует, что Семен Андреевич слыл человеком доступным и славился своим хлебосольством. От природы одаренный тонким и проницательным умом, он отлично умел приспосабливаться к обстоятельствам, со всеми умел уживаться и обладал особенным искусством распознавать людей. После него усадьбой владел его сын, граф Владимир Семенович, генерал-майор; затем внук - Сергей Владимирович. Последний и построил ныне существующую каменную Покровскую церковь. В 1804 г. была расширена трапезная, где устроены два придела. В церкви долгое время сохранялась икона Спасителя с надписью: "Сия святая икона поступила из бывшего Успенского Саввина и Серапионова монастыря, что в Шавпикине, от строителя старца Леонтия в 1765 г."

C 1904 по 1936 гг. в Покровской церкви служил священник Симеон Лилеев. Перед закрытием церкви это был последний настоятель, который был арестован и 13 октября 1937 г. расстрелян на полигоне в Бутово под Москвой.

В 1936 г. власти закрыли Покровский храм, после чего он был предан разграблению. Трапезная часть полностью уничтожена, а через нее устроена дорога в охотохозяйство. Уныло в стороне стоит обезглавленная колокольня, в которой еще сохранились остатки стенной росписи.

Богослужение возобновилось в 1993 г., когда была образована православная община.

На Духов День 2006 года сильным ветром сорвало с храма кровлю.

Храм в 1916 г.